Obs. Ingen danske undertekster. Denne udgave har kun engelske undertekster.

I sæson 16 må teamet som altid arbejde for USA's sikkerhed, og det starter med en verdensomspændende søgning efter deres egen chef, Vance.

Eskalerende trusler bliver til personlige missioner, når Bishop modsætter sig en ordre og genåbner en gammel sag, et marinehospital lukker ned på grund af skyderier, og Gibbs konfronteres med en eks-agent der kommer med en alvorlig advarsel...