Sackboy er tilbage, denne gang med spilbare nye venner i et helt nyt håndlavet eventyr. I LittleBigPlanet 3 er Sackboy transporteret til en ny planet kaldet Bunkum, et kreativt paradis, hvor mangfoldige idéer glider gennem himlen. 

Uforvarende kommer Sackboy til at hjælpe og frigive tre mytiske skabninger kaldet the Titans, der har til formål at ødelægge Bunkum og omdanne verdens Skaber, Newton, til et forfærdeligt monster. 

For at genoprette balancen i jorden har Sackboy brug for hjælp i form af Bunkums antikke helte: Toggle, OddSock og Swoop.