En dag åbnes døren til en anden verden, og ud går to mægtige drager. Midt i krigen mod hinanden forsvinder de helt pludseligt, og tilbage står en forundret menneskehed og et mystisk mørke. Tolv år efter tager tvillingerne Ai og Yu af sted på udkig efter sine forældre, der er forsvundet ind i den anden verden.

Et gådefuldt tog fører dem ind i denne verden, der er fuld af mystiske ting. Løst baseret på Tv-spillene med samme navn, er Final Fantasy: Unlimited, en skræmmende og besynderlig saga.