Alice (Milla Jovovich) skjuler sig i Nevada ørkenen, hvor hun sammen med en lille gruppe andre overlevne kæmper for at udrydde en dødelig virus, som truer med at udslette alt og alle. Mens Alice var i fangenskab hos Umbrella Corporation blev hun udsat for bio-genetiske eksperimenter, som har givet hende overnaturlig styrke, sanser og opfattelsesevne. Men det har Alice også brug, hvis nogen overhovedet skal overleve.